Fakultas kedokteran Universitas Muhammadiyah Palu diawali dengan dengan pembentukan tim taskforce berdasarkan SK Rektor Universitas Muhammadiyah Palu Nomor : 076/KEP/14/II.3.BAUK/D/XI/2023 tanggal, 21 November 2023 M bertepatan dengan 07 Jumadil Ula 1445 H, dengan ketua tim Sudirman, SKM, M.Kes. dan sekretaris Dr. Ahmad Yani, SKM, M.Kes, dan beberapa anggota tim yang ada dalam surat keputusan tersebut, setelah tim taskforce bekerja menyusun borang instrumen pembukaan program studi maka Rektor Unismuh Palu Prof. Dr. H. Rajindra, SE, MM, Menginisiasi untuk mencari Perguruan Tinggi Pengampuh sebagai salah satu syarat pendirian prodi kedokteran. Dimana rektor melakukan koordinasi dengan mejelis pendidikan Tinggi Penelitian dan Pengembangan Pimpin Pusat Muhammadiyah terkait dengan Perguruan Tinggi Pengampuh, maka saat itu direkomendasikan Universitas Muhammadiyah Makassar adalah salah satu PTMA yang telah terakreditasi Unggul Fakultas kedokterannya sebagai syarat PT Pendamping. maka berdasarkan Perjanjian kerjasama antara Fakultas kedokteran dan Ilmu Kesehatan Universitas Muhammadiyah Makassar dan Rektor Universitas Muhammadiyah Palu Nomor 116/UKS/FKIK/V/1445/2024 (Nomor MoU Unismuh Makasar) & 201/14/11.3.UMP/J/V/2024 (Nomor MoU Unismuh Palu) Tanggal 10 Mei 2024 tentang Universitas Muhammadiyah Makassar sebagai Institusi Pendamping Pendirian dan penyelanggaraan Pendididkan Kedokteran Universitas Muhammadiyah Palu.

Rekomendasi LLDIKTI XVI nomor 2510/LL16/KL.00.00/2024 tanggal 15 Oktober 2024 tentang Rekomendasi Pembukaan Prodi Kedokteran Program Sarjana dan Pendidikan Profesi Dokter Universitas Muhammadiyah Palu

Rekomendasi majelis Pendidikan tinggi penelitian dan pengembangan (Diktilitbang) pimpinan pusat Muhammadiyah Nomor : 1853/I.3/D/2024 tanggal 04 November 2024 bertepatan dengan 02 Jumadil Awwal 1446 H tentang rekomendasi/persetujuan pembukaan program studi baru tentang program studi kedokteran dan program studi profesi kedokteran di universitas Muhammadiyah palu

Rekomendasi Kementerian Kesehatan nomor : DP.01.05/Menkes/968/2024 tanggal 20 November 2024 tentang rekomendasi pembukaan program studi kedokteran program sarjana dan Program Studi Pendidikan Profesi Dokter Program Profesi serta pembentukan fakultas kedokteran Pada Universitas Muhammadiyah Palu

Fakultas kedokteran Universitas Muhammadiyah Palu Berdiri pada tanggal, 03 Oktober 2025 berdasarkan Surat Keputusan Menteri Pendidikan Tinggi Sains dan Teknologi Republik Indonesia Nomor : 839/B/O/2025 tentang Izin Pembukaan Program Studi Kedokteran Program Sarjana dan Program Studi Pendidikan Profesi Dokter Program Profesi Pada Universitas Muhammadiyah Palu di Kota Palu Yang diselenggarakan oleh Persyarikatan Muhammadiyah.